次世代シーケンサーのデータ解析技術

第251回農林交流センターワークショップ

近年、次世代シーケンサー（NGS）が広く利用されるようになり、農学など応用系の分野でも大量塩基配列データを扱う必要性は急速に高まりました。NGSによる塩基配列決定は低コスト化が進み、自らデータを取得しかつ解析することが多くの研究過程で求められています。
本ワークショップでは、農林水産生物に関わる研究者が、実習を通してNGSデータ解析の実際を知り、NGSデータを扱う実践的な力を身につけることを目標とします。コマンドラインでのさまざまなデータ解析を学び、NGSデータ解析の全体像を理解していただくことを目指します。

開催要領・日程	開催要領・日程表：(WORD : 98KB)／ (PDF : 244KB) ※掲載用のニュースは、こちらからダウンロードをお願いいたします。(PDF : 422KB)
開催日時	令和8年11月11日（水曜日）-11月13日（金曜日） ※3日間
開催場所	農林水産省農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター情報通信共同利用館（電農館）3階セミナー室（茨城県つくば市観音台2－1－9）
対象	産学官の試験研究機関の研究者で、次世代シーケンサーのデータ解析技術に関心のある方 ※Linux/Unixの基礎的なコマンドを理解し操作できて、例えば、lessコマンドの扱いなどに説明を要しないことを前提とします。申し込み多数の場合、実データを所有し、すぐに解析の必要性のある方を優先します（ネットワーク環境は、こちらで準備したものをご使用いただきます。実習で使用するノートPCは諸条件をご確認の上ご持参ください。）。
コーディネーター	国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構（農研機構）基盤技術研究本部高度分析研究センターゲノム情報大規模解析グループグループ長川原善浩・主任研究員熊谷真彦
定員	20名（全日程に参加することとし、代理の方の参加は認めていません）
参加費	無料（※受講後のアンケートの回答は必須です（5～15分程度）。）
その他	【重要】以下の条件を満たすノートPCをご持参ください。 OS:Windows11／MacOS ver15.0以降／Linux Ubuntsu 22.04 LTS 以降、または同等のLinuxディスとリビュージョン。 Wi-fi接続可能で、SSHによりリモートサーバへ接続できること。 Windows：PowerShell(OpenSSH)またはMobaXtermなど MacOS：Terminal.app,iTerm2など Linux：標準ターミナル ※OSは、最新の状態に更新してご持参ください。 ※トラブル対処のため、管理者権限でもログイン可能なノートPCをご持参ください。 ※ファイアウォール設定などでインターネットやTCP 22番ポート(SSH)への通信が制限されていないこと。その他ご不明な点がございましたら、下記担当者までご連絡ください。

講義と実習内容

令和8年11月11日（水曜日）

09時30分-09時35分	開講	本ワークショップについて（農研機構高度分析研究センター川原善浩）
09時35分-10時30分	実習	NGSデータ概論（川原善浩）
10時30分-12時00分	実習	ゲノムシーケンシングデータを処理する（1）（農研機構高度分析研究センター熊谷真彦）
13時00分-14時30分	実習	ゲノムシーケンシングデータを処理する（2）（熊谷真彦）
14時40分-15時40分	特別講義（1）	演題未定^※（大阪大学川崎純菜）
15時40分-16時40分	特別講義（2）	演題未定^※（調整中）

※特別講義（1）（2）につきましては、現在調整中です。演題及び講師が確定し次第Webページを更新いたしますので、しばらくお待ちください。

令和8年11月12日（木曜日）

09時30分-12時00分	実習	VCFデータを”いじってあそぼ!" ～分子系統解析や集団遺伝学的解析をやってみる時間～（農研機構高度分析研究センター矢﨑裕規）
13時00分-16時00分	実習	ゲノム新規アセンブル（農研機構高度分析センター矢野亮一）

令和8年11月13日（金曜日）

09時30分-12時00分	実習	メタゲノム解析の基礎（農研機構高度分析センター熊谷真彦）
13時00分-16時00分	実習	RNA-Seqによる大量発現データ解析（農研機構高度分析センター川原善浩）
16時00分-16時00分	閉講

お申し込み方法

参加ご希望の方は、こちらのフォームからお申込みください（外部リンク）。

【申込締切日：令和8年10月4日（日曜日）迄】

本ワークショップの受講は、先着順ではなくコーディネーターによる選考により決定いたします。
ご所属機関で希望者をまとめてお申込みされる場合、または申込フォームにアクセスできない方等は、下記より「申込書」及び「申込アンケート」をダウンロードしていただき、必要事項を入力後お問い合わせ窓口までメールにてご提出いただきますようお願いいたします（※申込締切日必着）。

申込書	(WORD : 29KB)	(PDF : 133KB)
申込アンケート	(WORD : 109KB)	(PDF : 196KB)

受講決定

結果につきましては、コーディネータによる選考後、10月9日頃メールにてお知らせいたします。

お問合せ先

農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター
コーディネーション推進課担当者
電話：029-838-7136 メール：koryu7129★maff.go.jp （※メール送信時、★印を@に変更してください。）

お問い合わせフォームへ

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