第238回農林交流センターワークショップ

次世代シーケンサーのデータ解析技術

近年、次世代シーケンサー（NGS）が広く利用されるようになり、農学など応用系の分野でも大量塩基配列データを扱う必要は急速に高まりました。NGSによる塩基配列決定は低コスト化が進み、自らデータを取得しかつ解析することが多くの研究過程で求められています。
本ワークショップでは、農林水産生物に関わる研究者が、実習を通してNGSデータ解析の実際を知り、NGSデータを扱う実践的な力を身につけることを目標とします。コマンドラインでのデータ解析を学び、また、我々が公開しているウェブサービスを利用することにより、NGSデータ解析の全体像を理解していただくことを目指します。

開催要領・日程	開催要領・日程表／ (WORD版 : 83KB) (PDF版 : 214KB) ※掲載用のニュースはこちらからダウンロード願います。(PDF : 917KB)
開催日時	2023年10月18日（水曜日）～ 10月20日（金曜日）3日間
開催場所	農林水産省農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター情報通信共同利用館（電農館）3階セミナー室（つくば市観音台2丁目1-9）
主催	農林水産省農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構高度分析研究センター
対象	産学官の試験研究機関の研究者で次世代シーケンサーのデータ解析技術に関心のある方 ※Linux/Unixの基礎的なコマンドを理解し操作できて、例えばlessコマンドの扱いなどに説明を要しないことを前提とします。申込み多数の場合、実データを所有し、すぐに解析の必要性のある方を優先します（PCとネットワーク環境はこちらで準備したものをご使用頂きます。）。
コーディネーター	国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構（農研機構）基盤技術研究本部高度解析研究センターゲノム情報大規模解析ユニットユニット長坂井寛章・主任研究員熊谷真彦
定員	20名（全日程に参加することとし、代理の方の参加は認めていません）
参加費	無料（※受講後のアンケートの回答は必須です（5～15分程度）。）
その他	開催当日、発熱や倦怠感など体調が思わしくない場合は、ワークショップへの参加を控えて頂きますようお願い致します。（欠席される場合は、下記担当者までご連絡ください。）感染症の蔓延等により、開催を中止することがあります。なお、開催中止により発生する費用（交通・宿泊取消料）は当方にて負担できませんので、ご了承ください。（当センター宿泊施設をご予約の場合、取消料は不要です。）講義内容の画面録画を行いますのでご了承ください。（質疑等、受講者の音声は削除します。農研機構の内部資料であり、外部への公開・配布は致しません。）

講義と実習内容

2023年10月18日（水曜日）

9時00分-9時05分	開講
9時00分-9時05分	挨拶	「本ワークショップについて」坂井寛章（農研機構高度分析研究センター）
9時05分-10時00分	実習	「NGSデータ概論」田中剛（農研機構高度分析研究センター）
10時00分-12時00分	実習	「ゲノムシーケンシングデータを処理する（1）」坂井寛章
13時00分-14時00分	実習	「ゲノムシーケンシングデータを処理する（2）」坂井寛章
14時00分-17時00分	実習	「ゲノム新規アセンブル」矢野亮一（農研機構高度分析研究センター）

2023年10月19日（木曜日）

9時00分-12時00分	実習	「RNA-Seqによる大量発現データ解析の基礎」川原善浩（農研機構高度分析研究センター）
13時00分-15時00分	実習	「RNA-Seqによる大量発現データ解析の応用」川原善浩
15時00分-16時00分	特別講義	「イネENCODE ～イネ全遺伝子の発現制御機構の同定に向けて～」川勝泰二（農研機構生物機能利用研究部門

2023年10月20日（金曜日）

9時00分-11時00分	実習	「メタゲノム解析の基礎」熊谷真彦（農研機構高度分析研究センター）
11時00分-12時00分	実習	「複雑なNGSデータ解析のGalaxyによる実現（1）」田中剛（農研機構高度分析研究センター）
13時00分-15時00分	実習	「複雑なNGSデータ解析のGalaxyによる実現（2）」田中剛
15時00分	閉講

お問合せ先

農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター
コーディネーション推進課
電話：029-838-7129 メール：
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