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農林水産技術会議

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第242回農林交流センターワークショップ

次世代シーケンサーのデータ解析技術

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  近年、次世代シーケンサー(NGS)が広く利用されるようになり、農学など応用系の分野でも大量塩基配列データを扱う必要は急速に高まりました。NGSによる塩基配列決定は低コスト化が進み、自らデータを取得しかつ解析することが多くの研究過程で求められています。

  本ワークショップでは、農林水産生物に関わる研究者が、実習を通してNGSデータ解析の実際を知り、NGSデータを扱う実践的な力を身につけることを目標とします。コマンドラインでのさまざまなデータ解析を学び、NGSデータ解析の全体像を理解していただくことを目指します。

開催要領・日程


開催要領・日程表 : (WORD : 82KB)(PDF : 209KB)
※掲載用のニュースは、こちらからダウンロードをお願いいたします。(PDF : 887KB)

開催日時


令和6年10月16日(水曜日)-10月18日(金曜日)3日間

開催場所


農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター
情報通信共同利用館(電農館)3階 セミナー室(茨城県つくば市観音台2-1-9)

対象


産学官の試験研究機関の研究者で、次世代シーケンサーのデータ解析技術に関心のある方
 ※Linux/Unixの基礎的なコマンドを理解し操作できて、例えばlessコマンドの扱いなどに説明を要しないことを前提とします。申し込み多数の場合、実データを所有し、すぐに解析の必要性のある方を優先します(PCとネットワーク環境はこちらで準備したものをご使用いただきます。)。

コーディネーター


国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構(農研機構)
基盤技術研究本部 高度分析研究センター ゲノム情報大規模解析ユニット
ユニット長 坂井 寛章  ・ 主任研究員 熊谷 真彦

定員


20名(全日程に参加することとし、代理の方の参加は認めていません)

参加費


無料(※受講後のアンケートの回答は必須です(5~15分程度)。)

その他


講義内容の画面録画を行う可能性がありますので、ご了承ください。
録画データは農研機構の内部資料であり、外部への公開配布はいたしません。
(質疑等の受講者の音声は削除致します。)

感染症の蔓延等により、開催が困難と判断された場合は、中止と致します。なお、開催中止に付随して発生する費用(交通う・宿泊取消料金)は、補償致しませんので、予めご了承下さい(当センター宿泊施設をご予約の場合の取消は不要です。)。


講義と実習内容

令和6年10月16日(水曜日)

09時00分-09時05分   開講  受講に関するご連絡 (ワークショップ事務局員)
挨拶  本ワークショップについて (農研機構高度分析研究センター 坂井 寛章)
09時05分-10時00分   実習  NGSデータ概論(農研機構高度分析研究センター 田中 剛)
10時00分-12時00分   実習  ゲノムシーケンシングデータを処理する(1)(坂井 寛章)
13時00分-14時30分   実習  ゲノムシーケンシングデータを処理する(2)(坂井 寛章)
14時30分-17時00分   実習  NGSデータをVCFデータにされて渡されたので、何かしら結果にしなきゃいけないと思っているあなたへ
 ~分子系統解析やら集団遺伝学的解析をやってみる時間~  (農研機構高度分析研究センター 矢﨑 裕規)

令和6年10月17日(木曜日)

9時00分-12時00分   実習  ゲノム新規アセンブル(農研機構高度分析センター 矢野 亮一)
13時00分-15時00分   実習  メタゲノム解析の基礎(農研機構高度分析センター 熊谷 真彦)
15時00分-16時00分   特別
講義
 未確定
 ※確定次第、ホームページにてご案内いたします。

令和6年10月18日(金曜日)

9時00分-12時00分   実習  RNA-Seqによる大量発現データ解析の基礎(農研機構高度分析研究センター 川原 善浩)
13時00分-15時00分   実習  RNA-Seqによる大量発現データ解析の応用(川原 善浩)
15時00分   閉講  


お申し込み方法

令和6年9月10日(火曜日)までにお申し込みください(必着)。<
農林交流センターワークショップの受講は、コーディネーターによる選考にて決定しております。
抽選及び先着順ではありません。

\ 9月10日(火曜日)までにお申し込み下さい。/

ワークショップのお申し込みはこちら >


申込フォームにアクセスできない場合

下記より申込書と申込アンケートをダウンロード後、koryu7129.gif 宛にメール添付にて
お申込頂きますようお願いいたします。

申込書
(WORD : 29KB) (PDF : 140KB)
申込アンケート
(WORD : 109KB) (PDF : 193KB)

受講者決定

令和6年9月17日頃メールにてお知らせいたします。

お問合せ先

農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター
コーディネーション推進課  鈴木、木暮
電話:029-838-7136  メール:koryu7129.gif
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