第194回農林交流センターワークショップ

植物科学・作物育種におけるフェノーム解析-はじめて画像解析を行う研究者のための入門実習-

趣旨

近年、先端的工学技術の生物研究への応用が急速に進んだことで、共通の性質を持つ生体分子の情報を大量かつ高感度に取得する網羅的分子生物学研究が可能になりました。
一方で、多様な対象を扱う表現型の大規模解析（フェノーム）においては、特定の技術の汎用的利用が困難であり、個々の研究者のニーズに対応した解析方法の開発が不可欠です。 本ワークショップでは、植物を対象とした顕微鏡から圃場までの様々なレベルのフェノーム研究を講義により紹介するとともに、パソコンで操作できるフリーソフトを使った画像解析について、初心者を対象とした実習を行い、フェノーム解析の一端を体験していただきます。

開催日時	2015年9月17日（木曜日）-9月18日（金曜日）
開催場所	農林水産技術会議事務局 筑波事務所 情報通信共同利用館（電農館）3階 セミナー室（つくば市観音台2-1-9)
主催	農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波事務所 国立研究開発法人農業生物資源研究所
対象	産学官の試験研究機関の研究者
コーディネーター	国立研究開発法人農業生物資源研究所  農業生物先端ゲノム研究センター ゲノム機能改変研究ユニット 主任研究員 土生 芳樹 氏 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 特任准教授 朽名 夏麿 氏
定員	20名
参加費	無料
交通費・宿泊費	各自負担（筑波事務所国内研修生宿泊施設をご利用頂けます。） 宿泊施設予約の有無は、受講決定後にお伺いします。

講義と実習内容

2015年9月7日（木曜日）

10時00分-10時05分	【挨拶】農林水産省農林水産技術会議事務局筑波事務所 研究交流課長 池田仁
10時05分-10時20分	【はじめに】「作物育種におけるフェノーム解析」                      農業生物資源研究所 農業生物先端ゲノム研究センター 土生芳樹
10時20分-11時10分	【講義】「画像解析の基礎知識」東京大学 朽名 夏麿
11時10分-12時00分	【講義】「画像解析を行うための方法とツール」東京大学 湖城 恵
13時00分-13時45分	【講義】「植物の画像解析の実例1－圃場生育環境下での解析」香川大学 杉田（小西）左江子
13時45分-14時30分	【講義】「植物の画像解析の実例2－業者委託による解析」エルピクセル(株) 島原 佑基
14時30分-15時15分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－ソフトウェアのインストールとデータのダウンロード」湖城 恵
15時30分-16時15分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－ファイルの入出力、関心領域(ROI)の設定」               エルピクセル(株) 相阪 有理
16時15分-17時15分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－二値化・領域抽出」エルピクセル(株) 長野 智晃

2015年9月8日（金曜日）

09時15分-10時30分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－数・形態・分布の解析」東京大学 朽名 夏麿
10時45分-12時00分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－色彩の解析」湖城 恵
13時00分-14時30分	【実習】「ImageJ を使った画像解析実習－多量の画像データに対する処理の自動化」 長野 智晃
14時30分-15時30分	【フリーディスカッション】土生芳樹、朽名夏麿・湖城 恵、相阪有理・島原佑基・長野智晃
15時30分-16時00分	【実習】「受講者からの質問に対する具体的な対応の例」                   土生芳樹、朽名夏麿・湖城 恵、相阪有理・島原佑基・長野智晃