第186回農林交流センターワークショップ

植物科学・作物育種におけるフェノーム解析-はじめて画像解析を行う研究者のための入門実習-

趣旨

近年、先端的工学技術の生物研究への応用が急速に進んだことで、共通の性質を持つ生体分子の情報を大量かつ高感度に取得する網羅的分子生物学研究が可能になりました。
一方で、多様な対象を扱う表現型の大規模解析（フェノーム）においては、特定の技術の汎用的利用が困難であり、個々の研究者のニーズに対応した解析方法の開発が不可欠です。

本ワークショップでは、植物を対象とした顕微鏡から圃場までの様々なレベルのフェノーム研究を講義により紹介するとともに、パソコンで操作できるフリーソフトを使った画像解析について、初心者を対象とした実習を行い、フェノーム解析の一端を体験していただきます。

開催日時	2014年10月2日（木曜日）-10月3日（金曜日）
開催場所	農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波事務所 情報通信共同利用館（電農館）3階 セミナー室（つくば市観音台2-1-9)
主催	農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波事務所 （独）農業生物資源研究所
対象	産学官の試験研究機関の研究者
コーディネーター	（独）農業生物資源研究所 農業生物先端ゲノム研究センター ゲノム機能改変研究ユニット 主任研究員土生芳樹 氏 東京理科大学 理工学部 応用生物科学科 教授 松永 幸大 氏
定員	20名
参加費	無料
交通費・宿泊費	各自負担（筑波事務所国内研修生宿泊施設をご利用いただけます。） 宿泊施設へのご予約は、受講決定後にお伺いいたします。

講義と実習内容

2014年10月2日（木曜日）

13時00分-13時05分	【はじめに】農林水産省農林水産技術会議事務局筑波事務所 研究交流課長 池田 仁
13時05分-13時10分	【本ワークショップのねらい】農業生物資源研究所 農業生物先端ゲノム研究センター 土生 芳樹
13時10分-13時55分	【講義】「画像解析の基礎知識」東京大学・エルピクセル(株) 朽名 夏麿
13時55分-14時40分	【講義】「画像解析を行うための方法とツール」東京大学・エルピクセル(株) 湖城 恵
14時55分-15時35分	【講義】「植物の画像解析の実例1－蛍光顕微鏡を使った解析」東京理科大学 松永 幸大
15時35分-16時05分	【講義】「植物の画像解析の実例2－圃場生育環境下での解析」香川大学 杉田(小西) 左江子
16時05分-16時35分	【講義】「植物の画像解析の実例3－業者委託による解析」湖城 恵
16時35分-17時15分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－ソフトウェアとデータのダウンロード」              朽名 夏麿・湖城 恵、東京理科大学 林 世莉

2014年10月3日（金曜日）

09時15分-10時30分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－二値化・領域抽出」朽名 夏麿・湖城 恵・林 世莉
10時45分-12時00分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－形態・分布や色の解析」朽名 夏麿・湖城 恵・林 世莉
13時00分-14時30分	【実習】「ImageJを使った画像解析実習－多量の画像データに対する統計解析」朽名夏麿・湖城恵・林世莉
14時30分-15時30分	休憩（フリーディスカッション）
15時30分-16時00分	【実習】「受講者からの質問に対する具体的な対応の例」朽名夏麿・湖城恵・林世莉