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農林水産技術会議

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第206回農林交流センターワークショップ

次世代シーケンサーのデータ解析技術   ※一般聴講可講義あり(10/11(水)10:30-12:00)

趣旨

近年、次世代シーケンサー(NGS)が広く利用されるようになり、農学など応用系の分野でも大量塩基配列データを扱う必要は急速に高まっています。NGSによる塩基配列決定は低コスト化が著しいことから、既に非常に大きなデータを抱えてしまっている方は多く、単にセミナーを聴講して情報収集をするだけでは十分な対応ができなくなっています。本ワークショップでは、農林水産生物に関わる研究者が、実習を通してNGSデータ解析の実際を知り、また経験者の最新情報を聴講することで、幅広い研究者がNGSデータを扱う基礎的な力を身につけることを目標とします。データ解析の基礎的な知識から説き起こし、一般的なコマンドラインでのデータ解析を経て、我々が公開しているウェブサービスを利用することにより、ユーザーにNGSデータ解析の全体像を理解していただくことを目指します。

開催日時


2017年10月11日(水曜日)-10月13日(金曜日)

開催場所


農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター
情報通信共同利用館(電農館) 3階 セミナー室・VCホール 
(つくば市観音台2-1-9)

対象


産学官の試験研究機関の研究者で、次世代シーケンサーのデータ解析に関心のある方

コーディネーター


国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 高度解析センター 
ゲノム情報大規模解析チーム チーム長 伊藤 剛 氏
ゲノム情報大規模解析チーム 主任研究員 田中 剛 氏

定員


30名

参加費


無料
受講後のアンケート回答は必須です(5~15分程度)。

交通費・宿泊費


各自負担(筑波産学連携支援センターの国内研修生宿泊施設をご利用頂けます。)
宿泊施設予約の有無は、受講決定後にお伺いします。

その他


※10月11日(水)10:30-12:00の下記講義には、一般の方もご参加いただけます。
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 会場:情報通信共同利用館(電農館) 3階 VCホール
 講義:「Oxford Nanoporeシークエンサーの基礎原理と
               MinION、GridIONの紹介と開発ロードマップ」
 講師:(株)オックスフォード・ナノポアテクノロジーズ 宮本真理 氏 
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参加ご希望の方は、「一般聴講お申し込みフォーム」よりお申し込み下さい。
※上記一般聴講可の講義のお申込み締切日は9月28日(木)です。ただし定員に達した時点で
締め切らせて頂きます。予めご了承下さい。


講義と実習内容

2017年10月11日(水曜日)

10時25分-10時30分 【挨拶】 農林水産省農林水産技術会議事務局 筑波産学連携支援センター コーディネーション推進課長 加藤 隆
10時30分-12時00分 【講義】「Oxford Nanoporeシークエンサーの基礎原理とMinION、GridIONの紹介と開発ロードマップ」(※一般聴講可)
             宮本真理((株)オックスフォード・ナノポアテクノロジーズ )  
13時00分-13時10分  【講義】「本ワークショップのねらい」 伊藤剛(農研機構 高度解析センター)
13時10分-14時00分  【実習】「NGSデータの基礎知識」 田中剛(農研機構 高度解析センター)
14時00分-15時30分 【実習】「Rによる統計解析の基礎」 伊藤剛 
15時30分-17時00分 【実習】「ゼロからはじめるNGSデータ解析」 沼寿隆(農研機構 高度解析センター) 

2017年10月12日(木曜日)

09時00分-11時00分 【実習】「ゲノムシーケンシングデータを処理する」 坂井寛章(農研機構 高度解析センター)
11時00分-12時00分 【講義】「MacでNGSデータ解析を構築する」 伊藤剛
13時00分-15時00分 【実習】「ゲノム新規アセンブルの方法論」 坂井寛章
15時00分-17時00分  【実習】「RNA-Seqによる大量発現データ解析の基礎」 川原善浩(農研機構 高度解析センター)  

2017年10月13日(金曜日)

09時00分-11時00分 【実習】「初心者でもGalaxyで簡単解析」 熊谷真彦(農研機構 高度解析センター)
11時00分-12時00分  【講義】「植物‐病原菌相互作用研究におけるNGSの活用例」 吉田健太郎(神戸大学先端融合研究環)
13時00分-15時00分 【実習】「複雑なNGSデータ解析のGalaxyによる実現」 田中剛



お申し込み方法

下記区分((1)または(2))により2017年9月8日(金曜日)までにお申し込みください(必着)。

農林交流センターワークショップでは、受講者についてはコーディネーターによる選考にて決定しております(抽選ではありません)。申込書は受講者選考の際の資料となりますので、応募理由を詳細に記入くださいますようお願いします。

(1)農林水産省関係の国立研究開発法人等に所属している方

下記の関係書式から申込書等をダウンロードし、機関の取りまとめ窓口を通じてお申し込みください。
申込書とアンケートを一緒にご提出いただく必要がありますのでご注意ください。

開催要領・日程表 (WORD : 84KB)  (PDF : 250KB) 
申込書  (WORD : 26KB)  (PDF : 202KB)
アンケート (WORD : 193KB)  (PDF : 234KB)

(2) 上記以外の方(大学・公立研究機関・民間企業等に所属している方で全日程受講希望者)

お申し込みフォームからお申し込み下さい。※一般聴講のみご希望の方は、下記(3)よりお申込み下さい。


(3) 10月11日(水曜日)の10時30分~12時までの講義へ参加希望される方

10月11日(水曜日)10時30分~12時までの講義には、一般の方もご参加頂けます。参加を希望される方は、下記「一般聴講お申し込みフォーム」よりお申し込み下さい。
一般聴講可の講義のお申込み締切日は9月28日(木)です。ただし定員に達した時点で締め切らせて頂きます。

一般聴講お申し込みフォームからお申し込み下さい。

受講者決定

2017年9月22日頃、メールにてお知らせいたします。 

お問合せ先

農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター
コーディネーション推進課鈴木(すずき)、木暮(きぐれ)
電話:029-838-7136  メール:koryu7129.gif
お問い合わせフォームへ
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